Minning cellular phosphoinositide-binding proteins by signaling pathway proteomics

• Auteur / Autrice : Christian Pasquali
• Direction : Daniel Thomas
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Stratégies d'exploitation des fonctions biologiques
• Date : Soutenance en 2004
• Etablissement(s) : Compiègne

Mots clés

Mots clés contrôlés

Chromatographie

Phosphatases

Phosphotransférases

Protéomique

Lipides

Protéines

Phospho-inositides

Mots clés libres

Signaux de transmission cellulaire

Pi3k

Résumé

Regroupée en trois thèmes, nos travaux ont été basés sur l'identification de cibles protéiques pouvant aboutir à des applications thérapeutiques dans l'inflammation et le système endocrinien. L'association de la protéomique avec les signaux de transmissions cellulaires a permis l'identification de nouveaux médiateurs protéiques impliqués dans le recrutement cellulaire, le système endocrinien et la biologie des lipides. Ainsi, PI3Ky est impliqué dans la migration des macrophages également induite par l'activation de Rac. Des phosphatases ont été identifiées comme étant spécifiques du récepteur, activé par l'hormone de croissance. Enfin, comme thème principal, notre stratégie globale utilisant la chromatographie d'affinité et un nouvel essai enzymatique a permis l'identification, la validation et la caractérisation fonctionnelle de nouvelles protéines interagissant avec les phosphoinostides cellulaires résultant de l'activation de PI3K.

To identify relevant cellular proteins involved in human pathophysiological processes and thereby, improve our understanding in cell-signalling mechanisms; we merged signaling knowledge with proteomics-based approaches. Ln the resulting functional findings, we first provide evidence for the involvement of the phosphoinositide-3 kinase gamma (PI3Ky) in chemokine-induced Rac-signaling in macrophages, Second, we show the identification of protein tyrosine phosphatases with specificity for the ligand-activated growth hormone receptor. Finally, and as main project, we describe a functional signalling-proteomics approach that allows the selective identification and characterization of navet cellular proteins that differentially recognize 3-phosphorylated phosphoinositides (PIPs). This study provides a three-way intersection of biological chemistry, lipid-mediated signaling, and proteomics to create a target oriented protein discovery platform for predefined subsets of the cellular proteome.