Thèse soutenue

FR  |  
EN
Accès à la thèse
Auteur / Autrice : Peggy Baudouin-Cornu
Direction : Dominique Thomas
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie
Date : Soutenance en 2002
Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

FR  |  
EN

Chez S. Cerevisiae, l'expression des gènes du métabolisme des acides aminés soufrés est soumise à une régulation négative spécifique: en milieu minimum contenant une forte concentration de méthionine, l'activateur transcriptionnel des gènes MET, Met4, est polyubiquitiné par le complexe ubiquitine-ligase SCF-Met30 et dégradé par le protéasome ; en milieu riche, l'oligo-ubiquitination de Met4 par le complexe SCF-Met30 empêche sa fixation sur les promoteurs des gènes MET. Dans ces deux conditions, les gènes MET ne sont pas transcrits. La première partie du mémoire présente une étude des mécanismes de régulation du complexe SCF-Met30. En particulier, nous montrons qu'en milieu riche comme en milieu minimum, l'exposition des cellules au cadmium déstabilise spécifiquement l'interaction entre Met30p et Skp1p, composants du complexe SCF-Met30, et inhibe l'ubiquitination de Met4p ; ceci a pour effet de rétablir la transcription des gènes MET. La deuxième partie du mémoire présente l'analyse statistique de la composition atomique de différentes populations de protéines. Elle montre l'existence de mécanismes spécifiques permettant aux organismes de faire face aux variations de disponibilité dans l'environnement des constituants élémentaires de leurs biopolymères. Ainsi, chez S. Cerevisiae et E. Coli, les protéines impliquées dans l'assimilation du soufre, carbone ou azote sont fabriquées avec moins de soufre, carbone ou azote respectivement. Par l'étude systématique des compositions atomiques des protéines de 46 organismes, nous avons ensuite observé que la composition en atomes de soufre et de carbone des protéines était spécifique des organismes. Ceci nous a amené à montrer l'existence d'une corrélation négative entre la température de croissance optimale des organismes thermophiles et la composition en atomes de soufre de leurs protéines et l'existence d'une corrélation forte entre le contenu en guanosine et cytosine des génomes et le contenu en carbone des protéines.