Approches genomiques pour l'identification des genes cibles de l'activateur transcriptionnel yap1p chez saccharomyces cerevisiae : nouvelles classes fonctionnelles et interconnections entre reseaux de regulation

• Auteur / Autrice : Hélène Dumond
• Direction : Monique Bolotin-Fukuhara
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1999
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

Chez saccharomyces cerevisiae, l'activateur transcriptionnel yap1p est implique dans la reponse cellulaire a differents stress. Afin de determiner la place de yap1p dans les reseaux de regulation nous avons recherche les cibles de ce facteur dans une banque de fusions traductionnelles et grace a l'utilisation de membranes a haute densite. Les variations qualitatives et quantitatives du transcriptome ont ete examinees en absence comme en presence de yap1p en conditions standard de culture ou apres traitement des cellules par l'h 2o 2. Les deux approches ont fourni des resultats coherents et conduit a l'identification de nombreux genes dont l'expression est directement ou indirectement sous le controle de yap1p. L'analyse informatique du promoteur de ces genes a montre que les variations d'expression observees ne dependaient pas toujours de la presence d'un site are (ap-1 responsive element). L'ensemble des resultats montre que le role de yap1p ne se limite pas a l'activation de la reponse adaptative a differents stress comme cela avait ete precedemment decrit : ce facteur peut agir positivement et negativement, a la fois en conditions standard et apres traitement des levures par l'h 2o 2. L'hybridation de membranes a haute densite a egalement permis de mettre en evidence un role regulateur de yap1p en conditions hypoxiques : les genes impliques dans la protection des cellules contre les radicaux oxygenes sont, dans ce cas, regules negativement par yap1p alors que plusieurs phases ouvertes de lecture de fonction inconnues sont regulees positivement. De plus, nous avons caracterise des interactions genetiques entre yap1p et cyp1p (hap1p), un activateur transcriptionnel implique dans la regulation des genes hypoxiques et mis en evidence des interconnections complexes entre ces deux reseaux de regulations. En conclusion, l'ensemble des resultats de ce travail suggere que yap1p pourrait etre un regulateur general de la reponse a l'oxygene chez saccharomyces cerevisiae.