Organisation et evolution du genome des angiospermes

• Auteur / Autrice : Nicolas Carels
• Direction : Giorgio Bernardi
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques fondamentales et appliquées
• Date : Soutenance en 1999
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Les relations genomiques degagees dans ce travail font apparaitre que l'ancetre commun des graminees a subi une transition de la composition en bases qui se traduit par l'augmentation en gc dans tous les constituants geniques et genomiques. Par opposition, cette transition n'a pas eu lieu dans la plupart des autres monocots et dicots. La transition compositionnelle renforce l'evidence de l'existence de deux classes de genes chez les angiospermes : les genes pauvres et riches en gc. Les premiers sont caracterises par la presence d'introns en plus grand nombre et de plus grande longueur que les derniers. Par ailleurs, les deux classes de genes chez les graminees ont, sur base de l'etude des substitutions synonymes, des taux d'evolution differentes et sont associees a des plans de fonction differents. La composition en bases est un facteur determinant de la localisation des genes dans le genome. Chez les graminees, la plupart des genes sont concentres dans un intervalle de composition en bases inferieur a 2%. Chez arabidopsis, la composition en gc est plus elevee aux parties distales des chromosomes que dans leurs parties centrales. La composition en gc des genes et des sequences codantes suit la meme tendance. Le genome d'arabidopsis peut etre decompose en 2 composantes principales, l'une pauvre en gc correspondant a la partie centrale des chromosomes, l'autre riche en gc, et quantitativement plus importante, correspondant aux parties distales des chromosomes.