Etude rmn du motif i intramoleculaire forme par des oligodesoxynucleotides derives des brins riches en cytidine des telomeres et centromeres

Nmr studies of intramolecular i-motif formed by the oligodeoxynucleotides derived from telomere and centromere cytosine rich strands

• Auteur / Autrice : XIAOGANG HAN
• Direction : Maurice Guéron
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1997
• Etablissement(s) : Palaiseau, Ecole polytechnique

Mots clés

Mots clés contrôlés

Résonance magnétique nucléaire

ADN

Biophysique

Résumé

Des etudes rmn multidimensionnelles ont montre que des sequences riches en cytidines adoptaient une structure constituee de deux duplexes intercales tete-beche l'un dans l'autre : le motif i. Nous etudions dans cette these la structure en motif i intramoleculaire adoptee par des oligodesoxynucleotides derivees des sequences telomeriques et centromeriques. Nous avons montre que la structure formee par la sequence d(5mcct#3c#2t#3ac#2t#3c#2) adopte le motif-i par un repliement intramoleculaire. Cette structure est stable a ph neutre, oc. Le cur de cette structure est forme par l'intercalation de quatre paires c. C#+, trois boucles liant les suites de cytidines. Dans la boucle centrale ttta, qui traverse le grand sillon, une liaison hydrogene entre les bases t8 et a11 a ete observee. Les deux boucles ttt, qui pontent les petits sillons, sont connectees par une paire symetrique t. T. Le travail concernant les sequences d(5mcct#3cct#2acct#3cc), d(5mcct#2ac#2t#3ac#2-t#2ac#2), d(5mccat#2c#2t#2ac#2at#2c#2) et d(5mccta#2c#2t#2ac#2ta#2c#2), montre une structure en motif i intramoleculaire, et la topologie de repliement est identique a celle decrite dans le cas precedent. Leur stabilite depend largement des longueurs et des compositions des boucles. La formation des appariements dans la boucle centrale et entre les deux petites boucles stabilise le motif i. Les valeurs de la temperature de denaturation thermique des sequences du telomere de bombyx d(5mcc(taacc)#3) et du centromere humain d(5mcc(attcc)#3) indiquent que les structures formees par ces deux sequences sont moins stables que les autres. Nous avons aussi etudie la possibilite de prolonger le repliement intramoleculaire en motif i, en ajoutant des sequences susceptibles de former un duplex d'adn b. L'existence de cette jonction entre le motif i et le duplex a ete observee.