Analyse structurale et fonctionnelle du genome de la levure saccharomyces cerevisiae

Structural and functional analysis of genome of yeast sacccharomyces cerevisiae

• Auteur / Autrice : Éric Coissac
• Direction : Pierre Netter
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1996
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Dans le cadre d'une collaboration internationale, la sequence nucleotidique du genome de la levure saccharomyces cerevisiae a ete entierement determinee. Au sein de ce projet, nous avons sequence un fragment d'adn de 39411 paires de bases correspondant aux regions telomerique et subtelomerique gauches du chromosome vii. Cette region comporte dix-huit phases ouvertes de lectures longues de plus de cent codons et une de soixante-seize. Parmi elles, six correspondent a des genes precedemment identifies : adh4, fzf1, hxk2, rtg2, hfm1 et pde1. La deletion de cinq autres a ete realisee (ygl257c, ygl255w, ygl250w, ygl249w et ygl246c). Deux de ces deletions (ygl250w et ygl246c) provoquent un retard de croissance sur milieu complet a une temperature de 28c. La phase ouverte ygl261c est un nouveau membre de la famille des seripauperines. Les caracteristiques de cette famille ont ete intensement etudiees. Cette etude montre qu'une pression de selection doit s'exercer sur cette famille afin de maintenir un de ces membres localise sur chacun des seize chromosomes. La deuxieme partie de cette these est consacree a l'analyse exhaustive des duplications de genes chez s. Cerevisiae et dans quatres organismes eucaryotes et bacteriens. Nos resultats montrent que le niveau de duplication de l'ensemble des genomes etudies est equivalent. Une etude plus approfondie demontre l'importance des telomeres dans les mecanismes de duplication chez la levure. Ces resultats suggerent qu'ils pourraient jouer le role de guides dans les processus de recombinaison ectopique.