Séquences répétées et expression normale ou pathologique des gènes de globines humaines

Repeated sequences and normal and abnormal expression of human globin genes

• Auteur / Autrice : Catherine Badens
• Direction : Jacques Elion
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie cellulaire et microbiologie
• Date : Soutenance en 1996
• Etablissement(s) : Aix-Marseille 2
• Partenaire(s) de recherche : autre partenaire : Université d'Aix-Marseille II. Faculté des sciences (1969-2011)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Gène de la bêta-globine

Résumé

Dans un travail sur les bases moleculaires de la variabilite phenotypique d'expression des hemoglobinopathies, nous avons ete amene a analyser le role des sequences repetees du dna dans le remaniement du genome et dans l'adoption de structures secondaires particulieres. Les alpha#+-thalassemies deletionnelles ont un effet protecteur sur la presentation des maladies dues a un defaut du gene beta-globine. Elles resultent de crossing over ingegaux entre des blocs de sequences homologues repetees. Nous avons mis au point une technique originale d'analyse de ces anomalies par pcr et determine leur frequence chez 121 patients drepanocytaires et/ou -thalassemiques. Chez un malade thalasso-drepanocytaire, nous identifions une mutation beta-thalassemique nouvelle et inhabituelle car de type deletion-insertion, et proposons un modele impliquant des sequences repetees dans son mecanisme d'apparition. Enfin, nous identifions un nouveau polymorphisme de type trinucleotide repete dans une region fonctionnellement importante du locus beta-globine: le site 3'hs1. Dans une deuxieme partie, nous demontrons par un abord theorique et experimental, l'existence d'une courbure du dna dans une region de regulation negative en amont du gene beta-globine. Cette region contient un motif polymorphe repete de type (at)xty et nous montrons que ce polymorphisme s'accompagne de variations dans la direction de la trajectoire du dna, a la sortie de la courbure. Notre hypothese est que ces variations structurales s'accompagnent de variations d'affinite pour la proteine represseur bp1 et, peut etre, de variations d'expression du gene en aval