Evolution de la famille multigenique des arn ribosomiques chez les enterobacteries. Implication en termes de phylogenie et de taxonomie

par VALERIE CILIA

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Richard Christen.

Soutenue en 1995

à Nice .

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  • Résumé

    Les genes presents en plusieurs copies dans un genome forment une famille multigenique. L'evolution concertee de ces genes permet la transmission d'une mutation fixee dans un membre de la famille des autres copies ou son elimination par des processus d'homogeneisation. Nous avons etudie la famille multigenique des genes des arnr chez e. Coli pk3 et s. Typhimurium sl4213. Les differents genes des arnr sont organises en operons et separes les uns des autres par des regions intergeniques qui peuvent posseder des genes des arnt. Ces genes sont cotranscrits en un arn precurseur. Les sequences des genes et de la region intergenique des operons rrn revelent un polymorphisme a l'interieur d'un organisme. Ce polymorphisme a revele l'importance des techniques d'obtention des sequences lors d'analyses phylogeniques entre especes proches. Les differences de sequences entre les differents operons peuvent etre ignorees si les sequences sont obtenues apres clonage ou par sequencage direct de produits amplifies. Ces differences de sequences s'averent importantes lors des analyses de taxonomie moleculaire. L'etude de la structure secondaire des differents operons rrn montre que l'apparition des mutations depend des contraintes exercees par la structure secondaire et permet d'etudier les relations existant entre la frequence de mutation et la pression de selection. Enfin, l'analyse comparative de ces differentes sequences nous a permis de mettre en evidence des phenomenes d'homogeneisation se produisant sur certains domaines des operons rrn. Ces phenomenes peuvent perturber les analyses phylogeniques entre especes proches en faussant les conditions d'homologie entre sequences comparees

  • Titre traduit

    Evolution of ribosomal rna multigene family within enterobacteriaceae. Implication in phylogeny and taxonomy


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  • Détails : 114 P.
  • Annexes : 188 REF.

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