Exploration de la biologie moleculaire du rice hoja blanca virus

Exploring the molecular biology of rice hoja blanca virus

• Auteur / Autrice : BERTHA-CECILIA RAMIREZ-GAMBA
• Direction : Anne-Lise Haenni
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1993
• Etablissement(s) : Paris 7

Résumé

Des etudes ont ete entreprises pour caracteriser le genome du tenuivirus rice hoja blanca virus (rhbv). Le rhbv est responsable de la maladie hoja blanca du riz, maladie presente dans presque tous les pays producteurs de riz d'amerique tropicale. Le vecteur du rhbv est l'insecte tagosodes orizicolus muir dans lequel le virus se multiplie egalement. Le genome du rhbv est compose de quatre arn simple-brin (designes arn1 a arn4 dans l'ordre decroissant de leur taille). Les analyses d'hybridation avec des sondes d'arn de polarite virale (v) ou virale complementaire (vc) ont montre que des quantites differentes d'arn4 des deux polarites ainsi qu'un arn4 subgenomique sont encapsides. Des etudes de traduction in vitro et d'immunoprecipitation ont montre que les arn totaux du rhbv dirigent la synthese de deux proteines de 23k (k=kilodalton) et de 21k. L'arn3 dirige la synthese de la proteine de 23k appelee ns3, et l'arn4 la synthese de la proteine de 21k appelee ns4. La proteine ns4 correspond a la proteine non structurale qui s'accumule dans les plantes infectees (proteine d'inclusion). La proteine nc n'est traduite in vitro ni par les arn totaux ni par l'un des arn isoles. La sequence complete de l'arn4 et partielle de l'arn3 du rhbv confirme l'utilisation par ces deux arn de la strategie d'expression ambisens. L'arn4v contient la phase ouverte de lecture (orf) de la proteine ns4, et l'arn4vc contient l'orf d'une proteine de 32,5k. L'arn3v contient l'orf de la proteine ns3, et l'arn3vc contient l'orf de la proteine nc. La strategie ambisens est utilisee par les arenaviridae, des virus appartenant a la famille des bunyaviridae, et par les tenuivirus. Les arn messagers du rhbv sont synthetises par cap-snatching, mecanisme decrit pour le virus de la grippe, pour les arenaviridae, et pour certains bunyaviridae