Distribution des bactéries microaérophiles dans les sédiments de langues côtières méditerranéennes : comparaison avec la distribution des bactéries aérobies et anaérobies. Etude des potentialités métaboliques

Distribution of microaerophilic bacteria in Mediterranean coastal lagoons sediments. Comparaison with aerobic and anaerobic bacteria distribution. Study of metabolic potentialITIES

• Auteur / Autrice : Maria Jesús Ferrara-Guerrero
• Direction : Armand Bianchi
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Océanologie
• Date : Soutenance en 1993
• Etablissement(s) : Aix-Marseille 2
• Partenaire(s) de recherche : autre partenaire : Université d'Aix-Marseille II. Faculté des sciences (1969-2011)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Bactéries aérobies

Bactéries marines

Bactéries anaérobies

Écologie des lagunes

Résumé

L'utilisation d'un milieu de culture semi-gelose (2 g. 1#-#1d'agar), a faible concentration en substrats organiques (0,5 g. 1#-#1 de succinate de calcium), et carence en azote combine, nous a permis de denombrer la population bacterienne microaerophile heterotrophe diazotrophe-succinotrophe dans l'eau et dans les sediments lagunaires. Ce milieu de culture faiblemente gelose permet la creation d'un systeme vertical de gradients d'oxygene qui favorise le developpement des bacteries microaerophiles sous forme d'anneaux de croissance bien delimites, dans les differentes couches de la colonne d'agar selon leurs besoins en oxygene. La pression partielle d'oxygene dissous optimale pour la croissance microaerophile est situe entre 114 et 6 m. Les bacteries microaerophiles se developpent dans les microniches suboxiques. La formation de microniches suboxiques pourrait etre expliquee par les changements dans la concentration en oxygene en raison de l'activite de l'endofaune benthique. Les effectifs de bacteries microaerophiles les plus nombreux (moyenne 4,6x10#3cellules cm#-#3 de sediment), ont ete trouves a l'interface oxique/anoxique des sediments. Les 25 souches microaerophiles gram negatif isolees lors de cette etude ont montre la presence de catalase dans une atmosphere de 8 a 21% d'oxygene, et seulement 64% d'entre elles la presentent a 4% d'oxygene ou sous conditions anoxiques. Les acides amines aliphatiques, les sucres et le mannitol sont des substrats plus utilises a faibles concentrations d'oxygene (4 et 8%) que sous conditions aerobies et anaerobies. Deux souches ont ete remarquees par leur nature strictement microaerophile (bis6 et bk25) ; toutes les autres ont presente un metabolisme anaerobie facultatif et/ou microaerophile