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des thèses françaises
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Caractérisation des souches de Frankia isolées des nodules de Casuarina : mise au point de marqueurs génétiques
| Auteur / Autrice : | Sylvie Nazaret |
| Direction : | Pascal Simonet |
| Type : | Thèse de doctorat |
| Discipline(s) : | Sciences |
| Date : | Soutenance en 1991 |
| Etablissement(s) : | Lyon 1 |
| Jury : | Examinateurs / Examinatrices : Pascal Simonet |
Mots clés
Résumé
Les souches de frankia isolees des nodules racinaires de casuarina different par leur aptitude a reinfecter leur hote d'origine. On distingue ainsi les souches typiques, infectives et les souches atypiques, non infectives sur l'hote d'origine. Ces dernieres sont par contre infectives sur d'autres plantes actinorhiziennes appartenant au genre elaeagnus. L'isolement de ces deux types de souches pourrait s'expliquer par la co-existence de deux souches a l'interieur d'un meme nodule, une souche infective sur casuarina et une souche infective sur elaeagnus. L'analyse de la diversite genetique de ces isolats basee sur la comparaison de profils de restriction au niveau des genes nif et rrn et l'analyse des relations phylogenetiques basee sur la comparaison de sequences amplifiees d'adn ribosomiques 16s ont revele l'absence de specificite etroite entre ces deux types d'isolats. De plus les souches atypiques constituent avec les souches isolees et infectives sur elaeagnus un groupe phylogenetique tres homogene. L'ensemble de ces donnees renforcant l'hypothese de coinfection nous nous sommes attaches a la mise au point de marqueurs genetiques de souches typiques et atypiques a partir de sequences oligonucleotidiques determinees au niveau des genes nif. Ces sondes testees vis-a-vis de nodules de terrain et de nodules issus d'une double inoculation souche typique/souche atypique ont dans tous les cas permis de detecter la presence de la souche typique. Par contre les methodologies utilisees se sont revelees inefficaces pour la detection de souches atypiques