Organisation en isochores du genome humain

Isochore organization of the human genome

• Auteur / Autrice : BRAHIM AISSANI
• Direction : Giorgio Bernardi
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1990
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

L'organisation du genome humain est abordee dans cette these par les trois niveaux gene, isochore et bande chromosomique. Dans un premier temps, nous avons montre l'existence de correlations de composition entre les sequences codantes, leurs differentes positions des codons et les introns, et les isochores ou les genes correspondants ont ete localises. Ces correlations ont indique que la distribution compositionnelle des genes dans le genome humain est fortement biaisee vers les isochores riches en gc. En effet, l'analyse des 1400 genes humains disponibles dans les banques de sequences a revele qu'environ un tiers des genes est distribue dans seulement 3% du genome qui correspond a la famille d'isochores la plus riche en gc, h3. Sur les deux tiers restants, la moitie est distribuee dans un tiers du genome qui correspond aux familles d'isochores h1 et h2, l'autre moitie est distribuee dans les deux tiers restants du genome qui sont representes par les familles d'isochores les plus riches en at, l1 et l2. Cette distribution fortement biaisee des genes est suivie par celle des sequences associees aux genes: les ilots de cpg. Ainsi, plus de la moitie des ilots de cpg est associee aux genes riches en gc qui resident dans la famille d'isochores h3. Dans un deuxieme temps, nous avons montre l'existence de correlations compositionnelles entre les isochores riches en at et les bandes chromosomiques giemsa positives ainsi qu'entre les isochores riches en gc et les bandes chromosomiques giemsa negatives ou reverses