Structures génotypiques multidimensionnelles : simulations, modélisations, analyses

Multidimensional genotypic structures: simulations, modelisation, analysis

• Auteur / Autrice : Eric Mathieu
• Direction : François Bonhomme
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Physiologie et biologie des organismes et populations
• Date : Soutenance en 1990
• Etablissement(s) : Montpellier 2

Mots clés

Mots clés contrôlés

Informatique

Analyse factorielle

Analyse multivariée

Simulation, Méthodes de

Modèles mathématiques

Génétique

Génotype

Génome

Génétique moléculaire

Génétique des populations

Résumé

Cette etude aborde la description de structures genetiques complexes de populations dans le cas ou un nombre important de locus sont examines simultanement. Nous avons fait appel a des techniques de description et d'analyses multidimensionnelles ainsi qu'a la modelisation par simulations. La premiere partie est consacree a l'evaluation des performances de ces techniques, c-'est-a-dire aux problemes de validation statistique. Nous developpons un test de l'ecart multilocus a l'equilibre de pardy-weinberg par methodes de reechantillonnage. La comparaison des lois de differents indices (homologie allelique, identite genetique et probabilite d'occurence) nous permet de proposer un test rapide conforme a l'idee que se font les geneticiens de la structuration. Dans une deuxieme partie, nous utilisons le simulateur de structures genotypiques construit precedemment pour analyser quelques-uns des facteurs causaux de l'ecart a la panmixie. En mesurant l'heterozygotie genomique et le desequilibre gametique moyen, nous analysons l'influence de la liaison genetique sur la generation de desequilibres d'associations aleatoires (effet hill-roberston)