Synthese de fragments d'arn par la methode au phosphotriester en phase liquide et sur support solide : etude conformationnelle d'hexameres comportant la methyl-5 cytidine par rmn

• Auteur / Autrice : FREDERIQUE CEOLIN
• Direction : Philippe Ascher
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1989
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Le travail presente decrit la synthese d'oligoribonucleotides par la methode au phosphotriester en solution et sur support solide. Les fonctions des nucleosides de depart ont ete protegees par des groupements acyles pour les amines des bases heterocycliques, le dimethoxytrityle pour l'hydroxyle en 5 du ribose et le benzoyle pour les hydroxyles en 2 et 3 des unites terminales. Deux groupements ont ete etudies pour la protection de la fonction alcool en 2 du ribose; nous avons envisage l'utilisation du methoxy-4 benzyle mais, devant les difficultes rencontrees quant a son clivage, nous avons opte pour un autre groupement, le benzoyle. En combinaison avec les groupements protecteurs mentionnes, il a permis dans un premier temps la realisation de l'octamere (ua)4 en phase liquide avec succes puis la preparation de quatre hexameres methyles. Appliquee a la technique sur support solide, cette strategie a conduit a la synthese de trois fragments d'arn (au)4, 6 et 8 dont la conformation a ete caracterisee par spectroscopie ir. L'etude par rmn des hexameres methyles et de cguacg a montre que l'influence de la methyl-5 cytosine est sequence-dependante; pour cgm#5cgcg, cam#5cgug et dans une certaine mesure cgcgm#5cg, elle favorise a temperature ambiante et a 0,1m nacl la formation d'une structure en appariement decale de deux residus comportant une mini-boucle a chaque extremite; pour cguam#5cg, une telle structure ne comporterait que des mesappariements et on observe une conformation de type a. Cette etude est une contribution a la comprehension du role des bases modifiees dans les molecules d'arn in vivo