Marie-Laure Martin-magniette
Marie-Laure Martin-magniette dirige actuellement les 2 thèses suivantes :
Estimation robuste par chemin de régularisation du support dans une régression linéaire en grande dimension. Application chez Arabidopsis thaliana pour identifier une organisation hiérarchique de ses facteurs de transcription.
par Perrine Lacroix sous la direction de Pascal Massart et de Marie-Laure Martin-magniette . - université Paris-Saclay
Mathématiques appliquées
En préparation depuis le 01-10-2019
Détection de motifs cis-régulateurs chez Arabidopsis thaliana et Zea mays : optimisation d'une méthode et développement d'un outil
par Julien Roziere sous la direction de Marie-Laure Martin-magniette - université Paris-Saclay
Biologie moléculaire et cellulaire
En préparation depuis le 30-09-2019
Marie-Laure Martin-magniette a dirigé les 5 thèses suivantes :
Inférence de réseaux de régulation orientés pour les facteurs de transcription d'Arabidopsis thaliana et création de groupes de co-régulation
par Yann Vasseur sous la direction de Gilles Celeux et de Marie-Laure Martin-Magniette . - Université Paris-Saclay (ComUE)
Mathématiques appliquées
Soutenue le 08-12-2017
A multivariate learning penalized method for a joined inference of gene expression levels and gene regulatory networks
par Trung Ha sous la direction de Marie-Laure Martin-Magniette , Julien Chiquet et de Guillem Rigaill . - Université Paris-Saclay (ComUE)
Sciences de la vie et de la santé
Soutenue le 02-12-2016
Enrichissement de profils transcriptomiques par intégration de données hétérogènes : annotation fonctionnelle de gènes d'Arabidopsis thaliana impliqués dans la réponse aux stress
par Rim Zaag sous la direction de Marie-Laure Martin-Magniette et de Etienne Delannoy . - Université Paris-Saclay (ComUE)
Bioinformatique
Soutenue le 20-06-2016
Modèles à variables latentes pour des données issues de tiling arrays : Applications aux expériences de ChIP-chip et de transcriptome
par Caroline Berard sous la direction de Stéphane Robin et de Marie-Laure Martin-Magniette . - Paris, AgroParisTech
Sciences pour l'ingenieur - Mathematiques, Informatique et Physique
Soutenue le 30-11-2011
Sélection de variables pour la classification non supervisée par mélanges gaussiens : application à l'étude de données transcriptomes
par Cathy Maugis sous la direction de Gilles Celeux et de Marie-Laure Martin-Magniette . - Paris 11
Mathématiques
Soutenue en 2008
Marie-Laure Martin-magniette a été président de jury des 5 thèses suivantes :
Modélisation mathématique de la dégradation des ARNm bactériens et intégration de données omiques
par Thibault Étienne sous la direction de Delphine Ropers et de Muriel Cocaign-Bousquet . - Lyon
Biostatistiques
Soutenue le 01-12-2020
Analyses de données omiques : clustering et inférence de réseaux
par Audrey Hulot sous la direction de Henri-Jean Garchon , Florence Jaffrézic et de Julien Chiquet . - université Paris-Saclay
Sciences de la vie et de la santé
Soutenue le 26-11-2020
Statistical approaches to detect epistasis in genome wide association studies
par Virginie Stanislas sous la direction de Christophe Ambroise et de Cyril Dalmasso . - Université Paris-Saclay (ComUE)
Sciences de la vie et de la santé
Soutenue le 18-12-2017
Analyse de données de métagénomique fonctionnelle par NMF pour la modélisation de la dégradation des fibres par le microbiote intestinal humain.
par Sébastien Raguideau sous la direction de Béatrice Laroche - Université Paris-Saclay (ComUE)
Mathématiques appliquées
Soutenue le 06-12-2016
Le processus de domiciliation des punaises hématophages vectrices de la maladie de Chagas : apport de l’étude du transcriptome chimiosensoriel
par Axelle Marchant sous la direction de Myriam Harry - Université Paris-Saclay (ComUE)
Biologie
Soutenue le 15-01-2016
Marie-Laure Martin-magniette a été rapporteur des 6 thèses suivantes :
Identification de déterminants génomiques impliqués dans la spécificité de fixation des facteurs de transcription.
par Raphaël Romero sous la direction de Jean-Michel Marin - Montpellier
Biostatistique
Soutenue le 14-12-2021
Inférence de réseaux pour modèles inflatés en zéro
par Clémence Karmann sous la direction de Anne Gégout-Petit et de Aurélie Muller-Gueudin . - Université de Lorraine
Mathématiques
Soutenue le 25-11-2019
Comparaison et évaluation d’approches bioinformatiques et statistiques pour l'analyse du pathobiome des plantes cultivées
par Charlie Pauvert sous la direction de Corinne Vacher et de Jessica Vallance . - Bordeaux
Écologie évolutive, fonctionnelle et des communautés
Soutenue le 12-11-2019
Mathematical modelling and integration of complex biological data : analysis of the heterosis phenomenon in yeast
par Marianyela Petrizzelli sous la direction de Dominique de Vienne et de Christine Dillmann . - Université Paris-Saclay (ComUE)
Sciences de la vie et de la santé
Soutenue le 08-07-2019
Approche intégrative du développement musculaire afin de décrire le processus de maturation en lien avec la survie néonatale
par Valentin Voillet sous la direction de Magali San Cristobal et de Laurence Liaubet . - Toulouse, INPT
Pathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition
Soutenue le 29-09-2016
Toward a multi-scale understanding of flower development - from auxin networks to dynamic cellular patterns
par Jonathan Legrand sous la direction de Arezki Boudaoud et de Yann Guédon . - Lyon, École normale supérieure
Sciences de la Vie
Soutenue le 07-11-2014
Marie-Laure Martin-magniette a été membre de jury de la thèse suivante :
Classification et inférence de réseaux pour les données RNA-seq
par Mélina Gallopin sous la direction de Gilles Celeux et de Florence Jaffrézic . - Université Paris-Saclay (ComUE)
Mathématiques aux interfaces
Soutenue le 09-12-2015
